SYNOPSIS

mk_angndx -s topol.tpr -n angle.ndx -[no]h -[no]version -nice int -type enum -[no]hyd -hq real

DESCRIPTION

mk_angndx makes an index file for calculation of angle distributions etc. It uses a run input file ( .tpx) for the definitions of the angles, dihedrals etc.

FILES

-s topol.tpr Input
 Run input file: tpr tpb tpa 

-n angle.ndx Output
 Index file 

OTHER OPTIONS

-[no]hno
 Print help info and quit

-[no]versionno
 Print version info and quit

-nice int 0
 Set the nicelevel

-type enum angle
 Type of angle:  angle,  dihedral,  improper or  ryckaert-bellemans

-[no]hydyes
 Include angles with atoms with mass  1.5

-hq real -1
 Ignore angles with atoms with mass  1.5 and |q|  hq