• Bio::MolEvol::CodonModel
• Bio::Nexml::Factory
• Bio::NexmlIO
• Bio::Ontology::DocumentRegistry
• Bio::Ontology::GOterm
• Bio::Ontology::InterProTerm
• Bio::Ontology::OBOEngine
• Bio::Ontology::OBOterm
• Bio::Ontology::Ontology
• Bio::Ontology::OntologyEngineI
• Bio::Ontology::OntologyI
• Bio::Ontology::OntologyStore
• Bio::Ontology::Path
• Bio::Ontology::PathI
• Bio::Ontology::Relationship
• Bio::Ontology::RelationshipFactory
• Bio::Ontology::RelationshipI
• Bio::Ontology::RelationshipType
• Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor
• Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor02
• Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine
• Bio::Ontology::Term
• Bio::Ontology::TermFactory
• Bio::Ontology::TermI
• Bio::OntologyIO
• Bio::OntologyIO::dagflat
• Bio::OntologyIO::goflat
• Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler
• Bio::OntologyIO::Handlers::InterPro_BioSQL_Handler
• Bio::OntologyIO::InterProParser
• Bio::OntologyIO::obo
• Bio::OntologyIO::simplehierarchy
• Bio::OntologyIO::soflat
• Bio::ParameterBaseI
• Bio::Parser::owl_to_obo_text
• Bio::Perl
• Bio::Phenotype::Correlate
• Bio::Phenotype::Measure
• Bio::Phenotype::MeSH::Term
• Bio::Phenotype::MeSH::Twig
• Bio::Phenotype::OMIM::MiniMIMentry
• Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry
• Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentryAllelicVariant
• Bio::Phenotype::OMIM::OMIMparser
• Bio::Phenotype::Phenotype
• Bio::Phenotype::PhenotypeI
• Bio::PhyloNetwork
• Bio::PhyloNetwork::Factory
• Bio::PhyloNetwork::FactoryX
• Bio::PhyloNetwork::GraphViz
• Bio::PhyloNetwork::muVector
• Bio::PhyloNetwork::RandomFactory
• Bio::PhyloNetwork::TreeFactory
• Bio::PhyloNetwork::TreeFactoryMulti
• Bio::PhyloNetwork::TreeFactoryX
• Bio::PopGen::Genotype
• Bio::PopGen::GenotypeI
• Bio::PopGen::HtSNP.pm
• Bio::PopGen::Individual
• Bio::PopGen::IndividualI
• Bio::PopGen::IO
• Bio::PopGen::IO::hapmap
• Bio::PopGen::IO::phase
• Bio::PopGen::IO::prettybase
• Bio::PopGen::Marker
• Bio::PopGen::MarkerI
• Bio::PopGen::PopStats
• Bio::PopGen::Population
• Bio::PopGen::PopulationI
• Bio::PopGen::Simulation::Coalescent